লাইব্রেরিটি কলেজ ভবন কমপ্লেক্সের প্রশাসনিক ব্লকের ঠিক উপরে, ১ম তলায় অবস্থিত, যেখানে 1,080 বর্গ মিটার ফ্লোর স্পেস রয়েছে। এটি একবারে 140 জন শিক্ষার্থীর বসার ক্ষমতা প্রদান করে এবং সমস্ত কর্মদিবসে সকাল ০৮ টা থেকে রাত ১০ টা পর্যন্ত খোলা থাকে।
স্নাতকোত্তর শিক্ষার্থীদের জন্য শিক্ষার পরিবেশ সহজতর করার জন্য একটি পৃথক স্নাতকোত্তর গ্রন্থাগার স্থাপন করা হয়েছে।
লাইব্রেরিতে সমস্ত প্রধান বিষয়ের বইয়ের সর্বশেষ সংস্করণ সহ বিভিন্ন শাখা এবং বিশেষত্বের 25000 টিরও বেশি বই রয়েছে। এটি বিদেশী জার্নাল সহ সমস্ত নেতৃস্থানীয় মেডিকেল জার্নাল নিয়মিত পায়। 
সমস্ত বই এবং জার্নাল কম্পিউটারাইজড ডাটাবেসের সাথে সঠিকভাবে সূচিবদ্ধ এবং তালিকাভুক্ত করা হয়েছে। এছাড়াও রেফারেন্সের জন্য বিভাগীয় ক্ষুদ্র গ্রন্থাগার রয়েছে।
ইনস্টিটিউটের শিক্ষার্থী ও কর্মীরা পাবলিক লাইব্রেরি সিলেটের লাইব্রেরি সুবিধা গ্রহণ করে। ঢাকার ন্যাশনাল মেডিকেল লাইব্রেরির সাথে আন্তঃগ্রন্থাগার বিনিময় কর্মসূচির সুবিধাও রয়েছে।